英文名稱：Metroid Prime 3 Corruption
《銀河戰士3：墮落》的故事發生在《銀河戰士Prime 2》的6個月之後。銀河聯邦的中央電腦突然遭受病毒的攻擊。銀河聯邦認為這是宇宙海盜所為，並召集了包括薩姆斯在內的賞金獵人。但是事態進一步升級，原本應該已經死亡的「黑暗薩姆斯」是這一事件的幕後主使，而他開始在星球四處播種污染物質Phazon。我們的英雄薩姆斯必須要對這些污染進行處理，並阻止「黑暗薩姆斯」。
通過Wii獨特的控制器，玩家可以用一隻手控制薩姆斯的移動，另一隻手則可以自由地進行鎖定和射擊，而玩家可以通過設定來調整指示器隨著在畫面上移動的快慢。
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